相比傳統(tǒng)的紙質(zhì)保函，電子保函無(wú)需抵押、無(wú)需反擔(dān)保、無(wú)需凍結(jié)資金，辦理簡(jiǎn)單便捷、方便查驗(yàn)真?zhèn)?、全程電子留痕，還可以在交易監(jiān)管方面發(fā)揮出重要作用。在工程保證和涉及政府采購(gòu)領(lǐng)域的投標(biāo)保證、履約保證等領(lǐng)域，紙質(zhì)保函和保證金作為兩種擔(dān)保方式，一直是市場(chǎng)上通行的做法。

保證金制度一直備受業(yè)界詬病，企業(yè)因交納投標(biāo)、履約等保證金，導(dǎo)致大量資金被占用，且周期很長(zhǎng)、負(fù)擔(dān)很重，嚴(yán)重阻礙了企業(yè)，特別是中小微企業(yè)的發(fā)展，而且保證金被挪用等違規(guī)違法案例也屢屢發(fā)生。

與保證金制度相比，紙質(zhì)保函的使用，降低了公共資源交易平臺(tái)的管理成本，對(duì)緩解投標(biāo)企業(yè)資金壓力起到了一定的作用。但紙質(zhì)保函仍存在很多漏洞，由于紙質(zhì)保函仍屬于實(shí)物保證憑證，沒(méi)有任何加密手段，在實(shí)際中存在無(wú)法驗(yàn)明真?zhèn)蔚那闆r，很容易造假。同時(shí)，也不便于平臺(tái)方進(jìn)行管理追蹤，招標(biāo)人索賠的效率不高。