檔案銷毀是保護機密信息的必要措施，需根據檔案類型、數量和敏感度選擇合適的方法，如物理銷毀法、數據擦除法、熱處理法和物理破壞法等。銷毀過程需嚴格控制并記錄，以確保信息不泄露且銷毀工作有效。

熱處理法：

熱力處理：將檔案放在高溫高壓設備中進行熱解處理，使其變成灰燼。

化學處理：使用化學試劑進行高溫化學處理，使檔案中的纖維和墨跡徹底分解。

檔案銷毀方式：

檔案可以送到指定造紙廠化成紙漿，這是銷毀大批量紙質檔案為常用的一種方式；數量少而又具有機密性的檔案應當先用碎紙機打碎再作處理；以磁帶磁盤、光盤等為載體的檔案，可以采用物理刪除、格式化或焚燒等方式銷毀。無論采取何種方式進行銷毀，都必須嚴格堅持兩人以上監(jiān)銷的原則。監(jiān)銷結束，監(jiān)銷人員須在銷毀清冊上簽字，并注明“已銷毀”字樣和銷毀方式、銷毀日期。已經銷毀的科技檔案，應在目錄上注銷,并對排列順序進行相應調整。

經鑒定可以銷毀的檔案，應當按照以下程序銷毀。

（一）機關檔案部門編制檔案銷毀清冊，列明擬銷毀檔案的檔號、文號、責任者、題名、形成時間、應保管期限、已保管時間和銷毀時間等內容，按檔案工作協(xié)調機制報請審核批準；

（二）機關分管檔案工作的單位負責人、辦公廳（室）負責人、檔案部門負責人、相關業(yè)務部門負責人、檔案部門經辦人、相關業(yè)務部門經辦人在檔案銷毀清冊上簽署意見；

（三）機關檔案部門組織檔案銷毀工作，并與相關業(yè)務部門共同派員監(jiān)銷。監(jiān)銷人在檔案銷毀前，應當按照檔案銷毀清冊所列內容進行清點核對；在檔案銷毀后，應當在檔案銷毀清冊上簽名或蓋章。銷毀清冊應當保存。