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北京市眼科研究所、北京市耳鼻咽喉科研究所、北京市糖尿病研究所與醫(yī)院主體并稱“一院三所”，成為集醫(yī)療、教學(xué)、科研、預(yù)防、國際交流五位一體的醫(yī)療科研聯(lián)合體。眼科、耳鼻咽喉科為教育部批準(zhǔn)的國家臨床重點學(xué)科，變態(tài)反應(yīng)(鼻過敏)科為原國家衛(wèi)生和計劃生育委員會批準(zhǔn)的國家臨床重點專科，中醫(yī)眼科學(xué)為國家中醫(yī)藥管理局批準(zhǔn)的中醫(yī)重點學(xué)科。首都醫(yī)科大學(xué)北京眼科學(xué)院和耳鼻咽喉科學(xué)院設(shè)在院內(nèi)。醫(yī)院設(shè)有世界衛(wèi)生組織防盲合作中心和世界衛(wèi)生組織防聾合作中心，附設(shè)北京同仁眼庫(國際眼庫協(xié)會會員)。

同仁醫(yī)院現(xiàn)有中國工程院院士1名，北京學(xué)者3名，長江學(xué)者1名，享受政府特殊津貼專家11名，獲、北京市突出貢獻專家12名。作為首都醫(yī)科大學(xué)第四臨床醫(yī)學(xué)院，醫(yī)院承擔(dān)著重要的教學(xué)任務(wù)。醫(yī)院現(xiàn)有學(xué)位點28個，其中博士學(xué)位點13個。碩士生導(dǎo)師114人，博士生導(dǎo)師41人。擁有15個北京市住院醫(yī)師培訓(xùn)基地。

專家門診掛號難，也容易落空的，所以可以開通專家預(yù)約電話，讓來訪者可以合理安排，也可使專家可以時間靈活安排。體檢排隊，是多數(shù)都有體會到的一項目服務(wù)，而為每次的排隊浪費大量的時候，使用電話排隊，可以讓體檢者不需要為時間擔(dān)心，可以做準(zhǔn)時到達。