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北京市眼科研究所、北京市耳鼻咽喉科研究所、北京市糖尿病研究所與醫(yī)院主體并稱(chēng)“一院三所”，成為集醫(yī)療、教學(xué)、科研、預(yù)防、國(guó)際交流五位一體的醫(yī)療科研聯(lián)合體。眼科、耳鼻咽喉科為教育部批準(zhǔn)的國(guó)家臨床重點(diǎn)學(xué)科，變態(tài)反應(yīng)(鼻過(guò)敏)科為原國(guó)家衛(wèi)生和計(jì)劃生育委員會(huì)批準(zhǔn)的國(guó)家臨床重點(diǎn)專(zhuān)科，中醫(yī)眼科學(xué)為國(guó)家中醫(yī)藥管理局批準(zhǔn)的中醫(yī)重點(diǎn)學(xué)科。首都醫(yī)科大學(xué)北京眼科學(xué)院和耳鼻咽喉科學(xué)院設(shè)在院內(nèi)。醫(yī)院設(shè)有世界衛(wèi)生組織防盲合作中心和世界衛(wèi)生組織防聾合作中心，附設(shè)北京同仁眼庫(kù)(國(guó)際眼庫(kù)協(xié)會(huì)會(huì)員)。

同仁醫(yī)院現(xiàn)有中國(guó)工程院院士1名，北京學(xué)者3名，長(zhǎng)江學(xué)者1名，享受政府特殊津貼專(zhuān)家11名，獲、北京市突出貢獻(xiàn)專(zhuān)家12名。作為首都醫(yī)科大學(xué)第四臨床醫(yī)學(xué)院，醫(yī)院承擔(dān)著重要的教學(xué)任務(wù)。醫(yī)院現(xiàn)有學(xué)位點(diǎn)28個(gè)，其中博士學(xué)位點(diǎn)13個(gè)。碩士生導(dǎo)師114人，博士生導(dǎo)師41人。擁有15個(gè)北京市住院醫(yī)師培訓(xùn)基地。

對(duì)于一些特殊性的科室（性病、特殊病等），可以做完全保密，完成門(mén)診預(yù)約，做人性化服務(wù)和信息化的科學(xué)結(jié)合。用戶(hù)如果通過(guò)電話(huà)掛號(hào)之后，當(dāng)日并沒(méi)有趕到醫(yī)院，則過(guò)期自動(dòng)退號(hào)，掛號(hào)費(fèi)自動(dòng)退回用戶(hù)賬號(hào)。