北京兒童醫(yī)院兒童保健中心設有新生兒行為測查、嬰幼兒撫觸、小兒生長發(fā)育及精神發(fā)育測評、兒童營養(yǎng)評價，聽力篩查、視力篩查、超聲骨密度檢查、超聲骨齡檢查、智力篩查、智力測評、0-1歲52項神經(jīng)運動檢查、氣質(zhì)測評、鉛損傷篩查、血鉛測查、微量元素測評、血常規(guī)測查、25羥維生素D檢測、注意力測評與訓練、孤獨癥測評、人體成分測查、早期發(fā)育訓練、語言測評、語言障礙訓練、保健咨詢以及健康教育，兒童免疫規(guī)劃等多項與保健相關(guān)的服務，同時也可接納幼兒園、中小學生集體兒童的健康體檢工作。其中，小兒生長發(fā)育與營養(yǎng)、精神發(fā)育測評與早期干預是中心的工作重點及亮點。

北京兒童醫(yī)院技術(shù)力量雄厚。擁有重點學科兒科學，國家兒童腫瘤監(jiān)測中心、國家呼吸系統(tǒng)疾病臨床醫(yī)學研究中心、國家中西醫(yī)協(xié)同旗艦醫(yī)院試點單位等12個平臺，8個國家臨床重點專科，5個北京市重點實驗室，2個北京市級研究平臺以及16個市級醫(yī)療中心。醫(yī)院設有疑難罕見病例會診中心和遠程會診中心，兒科疑難重癥疾病的診斷水平居國內(nèi)地位，是中華醫(yī)學會兒科學分會、兒外科分會，中國醫(yī)師協(xié)會小兒外科醫(yī)師分會，中華護理學會兒科專業(yè)委員會主任委員單位。

北京兒童醫(yī)院擁有教育部兒科學國家重點學科和教學團隊，是首都醫(yī)科大學兒科醫(yī)學院和兒科學系所在地，現(xiàn)有教授、副教授116人，承擔著本科及博士、碩士研究生、七年制兒科專業(yè)，護理大專及繼續(xù)醫(yī)學教育等多層次教學任務，并設有博士后流動站，每年為社會輸送大量兒科人才。

北京兒童醫(yī)院以病人為中心，全心全意為兒童服務，大力弘揚“公慈勤和”院訓精神，涌現(xiàn)出全國道德模范、全國共產(chǎn)黨員賈立群同志等杰出代表。醫(yī)院堅持公益，始終“關(guān)注兒童、關(guān)注健康”，成立“北京兒童健康基金會”，扶助困難家庭患兒就醫(yī);組織醫(yī)療骨干參加援疆援藏任務、“人才京郊行”、大型義診活動，為偏遠地區(qū)和基層單位的兒童送醫(yī)、送藥、送健康;開展免費救治西藏先心病、唇腭裂患兒活動，舉辦血友病、糖尿病、白血病兒童夏令營，讓患兒感受到社會的溫暖。