北京市眼科研究所、北京市耳鼻咽喉科研究所、北京市糖尿病研究所與醫(yī)院主體并稱(chēng)“一院三所”，成為集醫(yī)療、教學(xué)、科研、預(yù)防、國(guó)際交流五位一體的醫(yī)療科研聯(lián)合體。眼科、耳鼻咽喉科為教育部批準(zhǔn)的國(guó)家臨床重點(diǎn)學(xué)科，變態(tài)反應(yīng)(鼻過(guò)敏)科為原國(guó)家衛(wèi)生和計(jì)劃生育委員會(huì)批準(zhǔn)的國(guó)家臨床重點(diǎn)專(zhuān)科，中醫(yī)眼科學(xué)為國(guó)家中醫(yī)藥管理局批準(zhǔn)的中醫(yī)重點(diǎn)學(xué)科。首都醫(yī)科大學(xué)北京眼科學(xué)院和耳鼻咽喉科學(xué)院設(shè)在院內(nèi)。醫(yī)院設(shè)有世界衛(wèi)生組織防盲合作中心和世界衛(wèi)生組織防聾合作中心，附設(shè)北京同仁眼庫(kù)(國(guó)際眼庫(kù)協(xié)會(huì)會(huì)員)。

醫(yī)院設(shè)有眼底科、青光眼科、眼外傷科、白內(nèi)障中心、視光中心、眼角膜科、眼腫瘤科、眼肌科、眼中醫(yī)科、眼整形科、臨床檢查中心、中心防盲辦公室、同仁眼庫(kù)、北京市眼科研究所、耳科、鼻科、喉科、頭頸外科、中心防聾辦公室、北京市耳鼻咽喉科研究所、變態(tài)反應(yīng)科、心內(nèi)科、心外科、神經(jīng)內(nèi)科、消化內(nèi)科、呼吸內(nèi)科、腎內(nèi)科、內(nèi)分泌科、血液科、風(fēng)濕免疫科、感染科等科室。

其中眼科、耳鼻咽喉科為原衛(wèi)生部批準(zhǔn)的國(guó)家臨床重點(diǎn)專(zhuān)科，變態(tài)反應(yīng)科為國(guó)家衛(wèi)生和計(jì)劃生育委員會(huì)批準(zhǔn)的國(guó)家臨床重點(diǎn)專(zhuān)科，中醫(yī)眼科學(xué)為國(guó)家中醫(yī)藥管理局批準(zhǔn)的中醫(yī)重點(diǎn)學(xué)科。

青光眼科的臨床診療技術(shù)長(zhǎng)期居于國(guó)內(nèi)水平，接近國(guó)際水平，這是我們多年來(lái)的特色，也是在學(xué)術(shù)界常年保持水平的重要基礎(chǔ)。以惡性青光眼的診斷和為代表，在難治性青光眼的診斷和方面，始終處于國(guó)內(nèi)水平，這方面的研究成果先后獲得北京市科技進(jìn)步二等獎(jiǎng)和三等獎(jiǎng);在許多青光眼診斷技術(shù)的應(yīng)用方面，青光眼科都走在國(guó)內(nèi)同行的前列，比如應(yīng)用二極管激光睫狀體光凝技術(shù)各種難治性青光眼，應(yīng)用激光小粱成型術(shù)早期開(kāi)角型青光眼和殘余性青光眼，青光眼白內(nèi)障的聯(lián)合手術(shù)，非穿通小粱切除手術(shù)，引流植入物手術(shù)、粘小管成型術(shù)、小梁消融術(shù)、全周小梁切開(kāi)術(shù)先天性青光眼等。

青光眼科有博士研究生導(dǎo)師一人，碩士研究生導(dǎo)師兩人;有正高級(jí)職稱(chēng)人員5人，副高級(jí)職稱(chēng)人員人9人;青光眼科常年承擔(dān)首都醫(yī)科大學(xué)及首都醫(yī)科大學(xué)國(guó)際學(xué)院本科生、研究生、國(guó)際學(xué)生的臨床授課任務(wù);青光眼科每日的平均門(mén)診病人量200-300人次，科室開(kāi)放床數(shù)52張，年手術(shù)量超過(guò)3000臺(tái)，青光眼科住院部的床位使用率常年超過(guò)，術(shù)前平均住院日低于4天，各項(xiàng)醫(yī)療指標(biāo)位居全國(guó)前列。其中2/3的患者來(lái)自外地，每年培養(yǎng)研究生和進(jìn)修醫(yī)生近百名。