水母型的體壁結(jié)構(gòu)與水螅型基本相似，也是由兩層上皮肌肉細(xì)胞中間夾有中膠層構(gòu)成，但水母型的中膠層遠(yuǎn)較水螅型發(fā)達(dá)。體壁圍繞的胃循環(huán)腔也較發(fā)達(dá)，它或是一個(gè)簡單的囊，或是被膜分隔成4個(gè)胃囊，由胃囊向傘緣伸出4條（水螅綱水母）或更多的（缽水母）輻射管，并與傘緣平行的環(huán)管相連，由環(huán)管也可伸出離心的小管進(jìn)入觸手，直達(dá)觸手末端。在傘緣或觸手基部有感覺器官，例如眼點(diǎn)或平衡囊。

缽水母類的中膠層很發(fā)達(dá)，也是由蛋白質(zhì)及粘多糖形成的凝膠，其中含有膠原纖維。不同于水螅水母的是中膠層中游離著外胚層起源的變形細(xì)胞，這些變形細(xì)胞對動物的再生、組織修復(fù)起重要作用。中膠層也有很大的彈性，由于它能維持及調(diào)節(jié)離子的成分及濃度，而使身體在海水中保持一定的浮力。

缽水母類的神經(jīng)結(jié)構(gòu)也是由外胚層形成的神經(jīng)網(wǎng)，也具有突觸傳導(dǎo)。原始的種類例如立方水母類（Cubomedusae），也像水螅水母一樣，在傘緣具有兩個(gè)神經(jīng)環(huán)。但多數(shù)的缽水母類已不存在這種傘緣神經(jīng)環(huán)，而是神經(jīng)細(xì)胞集中，形成4個(gè)或8個(gè)神經(jīng)節(jié)分布在傘緣的觸手囊中。顯然，其中含有起博點(diǎn)神經(jīng)元，因?yàn)槿绻腥ト康纳窠?jīng)節(jié)，水母則失去博動的能力，如果切去部分神經(jīng)節(jié)，甚至只留一個(gè)神經(jīng)節(jié)，水母仍能做有節(jié)奏的收縮運(yùn)動。所以神經(jīng)節(jié)中含有起博點(diǎn)神經(jīng)元，它控制著水母類的肌肉收縮運(yùn)動。

缽水母類傘緣的4個(gè)或8個(gè)觸手囊也是它的神經(jīng)感覺中心，它具有感光、重力感受及化學(xué)感受的功能。觸手囊是由環(huán)管向外延伸形成一個(gè)中空的小盲管，其末端具有內(nèi)胚層分泌的鈣質(zhì)顆粒，稱平衡石（statolith）。外傘緣在平衡囊上端延伸形成笠（hood），用以保護(hù)及遮蓋下面的平衡囊，其兩側(cè)有感覺瓣（sensorylappets），其上有感覺細(xì)胞及纖毛。當(dāng)身體傾斜時(shí)，端部的結(jié)石與感覺纖毛受到刺激而引起運(yùn)動以調(diào)節(jié)身體的平衡。