無菌實(shí)驗(yàn)室設(shè)計(jì)的各項(xiàng)建筑物應(yīng)堅(jiān)固耐用、易于維修、易于清潔，并有能防止食品、食品接觸面及內(nèi)包裝材料遭受污染(如有害動物的侵入、棲息、繁殖等)的結(jié)構(gòu)。

為防止交叉污染，應(yīng)分別設(shè)置人員通道及物料運(yùn)輸通道，人員通道應(yīng)按潔凈室通道要求嚴(yán)格執(zhí)行，各通道應(yīng)裝有空氣幕(即風(fēng)幕)或雙向彈簧門及電子滅蠅(蚊)器等防蟲設(shè)施。

須將通向外界的管路、門窗和通風(fēng)道四周的空隙完全充填，所有窗戶、通風(fēng)口和風(fēng)機(jī)開口均應(yīng)裝上防護(hù)網(wǎng)。

無菌實(shí)驗(yàn)室的高度應(yīng)能滿足工藝、衛(wèi)生要求，以及設(shè)備安裝、維護(hù)、保養(yǎng)的需要。

無菌實(shí)驗(yàn)室專辟于微生物實(shí)驗(yàn)室內(nèi)，室外室內(nèi)裝備的換氣設(shè)備必須有空氣過濾裝置。在獲得了無菌環(huán)境和無菌材料后，只有保持無菌狀態(tài)，才能對某種特定的已知微生物進(jìn)行研究。所以控菌能力和控菌穩(wěn)定性是無菌室的核心驗(yàn)收指標(biāo)。業(yè)內(nèi)通行的驗(yàn)收標(biāo)準(zhǔn)為100級潔凈區(qū)平板雜菌數(shù)平均不得超過1個菌落，10000級潔凈室平均不得超過3個菌落，在通行標(biāo)準(zhǔn)之外，還應(yīng)該定期保養(yǎng)與維護(hù)。只有建設(shè)時(shí)合理的選材指標(biāo)，合適凈化等級和長期管理與維護(hù)，才能使無菌實(shí)驗(yàn)室發(fā)揮其應(yīng)有的作用。

由于潔凈實(shí)驗(yàn)室-生物實(shí)驗(yàn)室的特殊性，除了進(jìn)行嚴(yán)格的設(shè)計(jì)、施工、調(diào)試外，為確保其性，必須對其進(jìn)行必要的工程檢測和嚴(yán)格的驗(yàn)收，達(dá)到要求和使用要求后才可投入運(yùn)行。另外，使用過程中的一些因素，如非專業(yè)的管理和使用，過濾器的更換等，都會對實(shí)驗(yàn)室的性產(chǎn)生影響，因此，使用中的定期檢測與同樣重要。