無菌定義是要求沒有活體微生物的存在，為了達到無菌車間內(nèi)沒有活體微生物，無菌車間在產(chǎn)品制造過程中需要采取各種方法來去除制品中原有的微生物和防止制品受到微生物的污染。

一個普通的無塵凈化車間，會涉及到凈化裝飾、地面、凈化空調(diào)與通風系統(tǒng)、冷熱源系統(tǒng)、照明系統(tǒng)、動力系統(tǒng)、通信系統(tǒng)、監(jiān)控系統(tǒng)、自動化控制系統(tǒng)、給排水系統(tǒng)、工藝管道系統(tǒng)等工程。

無菌車間又叫無菌室，它的要求更高，除了按潔凈室要求處理空氣中微粒外，還需要對室內(nèi)空氣進行處理，即同時要去除生物污染源，對室檢查還需要對室內(nèi)空氣采樣培養(yǎng)，以杜絕感染源。醫(yī)院手術(shù)室、血液透析室、藥品及三類一次性醫(yī)療用品生產(chǎn)都要求使用無菌室；但是檢測時需要檢測浮游菌、沉降菌等菌落數(shù)。

無菌容器和密封件以及灌裝封口作業(yè)的局部暴露區(qū)域內(nèi)空氣的潔凈度應(yīng)達到100級要求，該潔凈度下每立方米空氣中含有≥0.5靘的粒子數(shù)應(yīng)不得過3500個，空氣浮游菌的含量應(yīng)不得超過5CFU/m3。

無菌操作區(qū)域內(nèi)的100級潔凈區(qū)內(nèi)的空氣在其使用點處應(yīng)經(jīng)過濾器過濾后呈單向流態(tài)（層流）輸送，流速應(yīng)滿足空氣以活塞的方式吹除灌封區(qū)內(nèi)的懸浮粒子的需要。

食品無塵無菌包裝是指將經(jīng)過后已獲得商業(yè)無塵無菌狀態(tài)的產(chǎn)品，封閉在已的容器中，在無塵無菌環(huán)境下灌注，灌裝后包裝容器保持密封以防止再度感染，以期在不加防腐劑、不經(jīng)冷藏條件下得到較長的貨架壽命的包裝方法。